Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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