Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms