Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kdm6bQ5NCY0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm6bQ5NCY0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm6bQ5NCY0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms