Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef6Q5NCJ1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms