Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm12253Q5NC48 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm12253Q5NC48 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12253Q5NC48 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm12253Q5NC48 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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