Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
1810065E05RikQ5NC41 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810065E05RikQ5NC41 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms