Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkaa1Q5EG47 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms