Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hspb6Q5EBG6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspb6Q5EBG6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms