Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GpkowQ56A08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GpkowQ56A08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms