Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl1Q52KE7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms