Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem171Q4KL18 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms