Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms