Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shank3Q4ACU6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms