Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1nQ497L1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms