Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms