Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Dnah12Q3V0Q1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Dnah12Q3V0Q1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Dnah12Q3V0Q1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms