Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms