Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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