Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfi1Q3UZY0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms