Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnpc3Q3UZ01 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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