Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms