Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms