Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm5aQ3UXZ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms