Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms