Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Skap1Q3UUV5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Skap1Q3UUV5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms