Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScimpQ3UU41 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ScimpQ3UU41 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms