Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms