Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms