Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgef40Q3UPH7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms