Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UPC7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UPC7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UPC7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UPC7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3UPC7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UPC7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms