Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms