Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cog7Q3UM29 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms