Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fhdc1Q3ULZ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms