Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ell2Q3UKU1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms