Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edc4Q3UJB9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edc4Q3UJB9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms