Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms