Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Garem1Q3UFT3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garem1Q3UFT3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms