Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nom1Q3UFM5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nom1Q3UFM5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms