Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Puf60Q3UEB3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms