Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms