Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pid1Q3UBG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms