Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Gtpbp6Q3U6U5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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Gtpbp6Q3U6U5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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