Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl21Q3U410 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl21Q3U410 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl21Q3U410 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl21Q3U410 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl21Q3U410 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klhl21Q3U410 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl21Q3U410 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms