Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serac1Q3U213 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms