Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pag1Q3U1F9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pag1Q3U1F9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pag1Q3U1F9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pag1Q3U1F9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pag1Q3U1F9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pag1Q3U1F9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms