Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms