Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0X8

Cd96, T-cell surface protein tactile, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd96Q3U0X8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd96Q3U0X8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms