Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D17Wsu92eQ3TT38 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
D17Wsu92eQ3TT38 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms