Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fndc4Q3TR08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Fndc4Q3TR08 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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