Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TQQ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TQQ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms